Самый крупный образовательный проект Фонда, существующий с 2000 года. Программа объединяет профессионалов из сферы высшего образования и смежных областей, готовых сделать свой вклад в развитие общества и обеспечивать устойчивость изменений.

Состав комиссии утвержден распоряжением российского правительства. Комиссию возглавил заместитель председателя правительства Александр Жуков. Президентская программа подготовки управленческих кадров действует в соответствии с Указом президента Российской Федерации от 23 июля 1997 года. Ее задача - содействовать подготовке для реального сектора экономики руководителей нового типа, способных эффективно работать в рыночных условиях. Программа должна способствовать модернизации экономики, реструктуризации российских предприятий, развитию малого и среднего предпринимательства, скорейшей интеграции России в мировую экономику.